MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 20269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004842	G	6	6	30124	30129	0 %	0 %	100 %	0 %	56416399
502	NC_004842	GGGT	2	8	30147	30154	0 %	25 %	75 %	0 %	56416399
503	NC_004842	CA	3	6	30251	30256	50 %	0 %	0 %	50 %	56416399
504	NC_004842	ATT	2	6	30292	30297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416399
505	NC_004842	TGC	2	6	30354	30359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416399
506	NC_004842	ACA	2	6	30444	30449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416399
507	NC_004842	TGC	2	6	30534	30539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416399
508	NC_004842	AGCG	2	8	30544	30551	25 %	0 %	50 %	25 %	56416399
509	NC_004842	ATG	2	6	30576	30581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416399
510	NC_004842	A	6	6	30603	30608	100 %	0 %	0 %	0 %	56416399
511	NC_004842	TAC	2	6	30702	30707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416399
512	NC_004842	CTG	2	6	31198	31203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416400
513	NC_004842	TGC	2	6	31204	31209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416400
514	NC_004842	TG	3	6	31217	31222	0 %	50 %	50 %	0 %	56416400
515	NC_004842	GTT	2	6	31273	31278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416400
516	NC_004842	TGC	2	6	31376	31381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416400
517	NC_004842	TGA	2	6	31392	31397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416400
518	NC_004842	AGAAGC	2	12	31455	31466	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	56416400
519	NC_004842	AGA	2	6	31554	31559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416400
520	NC_004842	TGA	2	6	31653	31658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416400
521	NC_004842	TGAG	2	8	31745	31752	25 %	25 %	50 %	0 %	56416400
522	NC_004842	GCT	2	6	31938	31943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416400
523	NC_004842	CAA	2	6	32105	32110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416400
524	NC_004842	CTG	3	9	32192	32200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416400
525	NC_004842	AGC	2	6	32215	32220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416400
526	NC_004842	GGT	2	6	32266	32271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416400
527	NC_004842	GCC	2	6	32366	32371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416400
528	NC_004842	CAG	2	6	32423	32428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416401
529	NC_004842	GT	3	6	32447	32452	0 %	50 %	50 %	0 %	56416401
530	NC_004842	CGGC	2	8	32476	32483	0 %	0 %	50 %	50 %	56416401
531	NC_004842	GT	3	6	32551	32556	0 %	50 %	50 %	0 %	56416401
532	NC_004842	TGC	2	6	32563	32568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416401
533	NC_004842	GCG	2	6	32573	32578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416401
534	NC_004842	CAGT	2	8	32650	32657	25 %	25 %	25 %	25 %	56416401
535	NC_004842	AGA	2	6	32659	32664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416401
536	NC_004842	TCC	2	6	32766	32771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416401
537	NC_004842	CGT	2	6	32783	32788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416401
538	NC_004842	GGT	2	6	32825	32830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416401
539	NC_004842	A	7	7	32862	32868	100 %	0 %	0 %	0 %	56416401
540	NC_004842	CTA	2	6	32902	32907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416401
541	NC_004842	GC	3	6	32948	32953	0 %	0 %	50 %	50 %	56416401
542	NC_004842	CGA	2	6	32958	32963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416401
543	NC_004842	TAG	2	6	32965	32970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416401
544	NC_004842	TCT	2	6	33139	33144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416402
545	NC_004842	CAC	2	6	33211	33216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416402
546	NC_004842	GCA	2	6	33225	33230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416402
547	NC_004842	CAAC	2	8	33277	33284	50 %	0 %	0 %	50 %	56416402
548	NC_004842	AAC	2	6	33401	33406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416402
549	NC_004842	ATC	2	6	33416	33421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416402
550	NC_004842	GCA	2	6	33468	33473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416402
551	NC_004842	TAC	2	6	33503	33508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416402
552	NC_004842	AC	3	6	33628	33633	50 %	0 %	0 %	50 %	56416403
553	NC_004842	ACC	2	6	33693	33698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416403
554	NC_004842	ATG	2	6	33705	33710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416403
555	NC_004842	CAG	2	6	33772	33777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416403
556	NC_004842	CTG	2	6	33786	33791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416403
557	NC_004842	TAG	2	6	33805	33810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416403
558	NC_004842	CTG	2	6	33814	33819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416403
559	NC_004842	TGA	2	6	33820	33825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416403
560	NC_004842	TCA	2	6	36769	36774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416404
561	NC_004842	AAG	2	6	36780	36785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416404
562	NC_004842	TTG	2	6	36789	36794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416404
563	NC_004842	CTT	2	6	36881	36886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416404
564	NC_004842	CT	3	6	36897	36902	0 %	50 %	0 %	50 %	56416404
565	NC_004842	ATT	2	6	36987	36992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416404
566	NC_004842	TTC	2	6	37016	37021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416404
567	NC_004842	CATC	2	8	37033	37040	25 %	25 %	0 %	50 %	56416404
568	NC_004842	ATG	2	6	37071	37076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416404
569	NC_004842	GTGA	2	8	37077	37084	25 %	25 %	50 %	0 %	56416404
570	NC_004842	GAA	2	6	37115	37120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416404
571	NC_004842	CCA	2	6	37155	37160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416404
572	NC_004842	GAT	2	6	37176	37181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416404
573	NC_004842	TAG	2	6	37226	37231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416404
574	NC_004842	CTTC	2	8	37240	37247	0 %	50 %	0 %	50 %	56416404
575	NC_004842	TCA	2	6	37317	37322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416404
576	NC_004842	CTG	2	6	37448	37453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416404
577	NC_004842	GGT	2	6	37479	37484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416404
578	NC_004842	ATG	2	6	37524	37529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416404
579	NC_004842	GC	3	6	37536	37541	0 %	0 %	50 %	50 %	56416404
580	NC_004842	TCTT	2	8	37551	37558	0 %	75 %	0 %	25 %	56416404
581	NC_004842	CT	3	6	37572	37577	0 %	50 %	0 %	50 %	56416404
582	NC_004842	TCCTC	2	10	37594	37603	0 %	40 %	0 %	60 %	56416404
583	NC_004842	GTAC	2	8	37633	37640	25 %	25 %	25 %	25 %	56416404
584	NC_004842	TC	3	6	37700	37705	0 %	50 %	0 %	50 %	56416404
585	NC_004842	CTT	2	6	37763	37768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416404
586	NC_004842	ATC	2	6	37793	37798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416404
587	NC_004842	TGCT	2	8	37801	37808	0 %	50 %	25 %	25 %	56416404
588	NC_004842	AAACCC	2	12	37835	37846	50 %	0 %	0 %	50 %	56416404
589	NC_004842	CTA	2	6	37861	37866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416404
590	NC_004842	CCT	2	6	37887	37892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416404
591	NC_004842	ACT	2	6	37956	37961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416404
592	NC_004842	CTC	2	6	37967	37972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416404
593	NC_004842	CTC	2	6	37988	37993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416404
594	NC_004842	CA	3	6	38014	38019	50 %	0 %	0 %	50 %	56416404
595	NC_004842	CCCT	2	8	38029	38036	0 %	25 %	0 %	75 %	56416404
596	NC_004842	CTT	2	6	38064	38069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416404
597	NC_004842	GGA	2	6	38084	38089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416404
598	NC_004842	TTG	2	6	38115	38120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416404
599	NC_004842	TC	6	12	38279	38290	0 %	50 %	0 %	50 %	56416405
600	NC_004842	CCA	2	6	38293	38298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416405
601	NC_004842	ATA	2	6	38310	38315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416405
602	NC_004842	TCA	2	6	38319	38324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416405
603	NC_004842	TCG	2	6	38416	38421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416405
604	NC_004842	CTC	2	6	38544	38549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416405
605	NC_004842	ACC	2	6	38583	38588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416405
606	NC_004842	TAT	2	6	38767	38772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416405
607	NC_004842	CCA	2	6	38773	38778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416405
608	NC_004842	GAC	2	6	38826	38831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416405
609	NC_004842	TCC	2	6	39290	39295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416406
610	NC_004842	AAG	2	6	39299	39304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416406
611	NC_004842	CCA	2	6	39348	39353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416406
612	NC_004842	GC	3	6	39420	39425	0 %	0 %	50 %	50 %	56416406
613	NC_004842	GTT	2	6	39544	39549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416407
614	NC_004842	GCTGC	2	10	39595	39604	0 %	20 %	40 %	40 %	56416407
615	NC_004842	GGCAA	2	10	39699	39708	40 %	0 %	40 %	20 %	56416407
616	NC_004842	TGA	2	6	39731	39736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416407
617	NC_004842	TG	3	6	39749	39754	0 %	50 %	50 %	0 %	56416407
618	NC_004842	TGAG	2	8	39885	39892	25 %	25 %	50 %	0 %	56416408
619	NC_004842	GCT	2	6	39911	39916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416408
620	NC_004842	AGA	2	6	39928	39933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416408
621	NC_004842	TGC	2	6	39987	39992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416408
622	NC_004842	AGC	2	6	40110	40115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416408
623	NC_004842	CTGC	2	8	40154	40161	0 %	25 %	25 %	50 %	56416408
624	NC_004842	CAG	2	6	40216	40221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416408
625	NC_004842	TGAG	2	8	40227	40234	25 %	25 %	50 %	0 %	56416408
626	NC_004842	GC	4	8	40319	40326	0 %	0 %	50 %	50 %	56416408
627	NC_004842	CGGC	2	8	40363	40370	0 %	0 %	50 %	50 %	56416408
628	NC_004842	CGT	2	6	40392	40397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416408
629	NC_004842	ACT	2	6	40569	40574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416408
630	NC_004842	GC	3	6	40592	40597	0 %	0 %	50 %	50 %	56416408
631	NC_004842	TTC	2	6	40625	40630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416408
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756	NC_004842	A	6	6	51716	51721	100 %	0 %	0 %	0 %	56416417
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759	NC_004842	GTT	2	6	51792	51797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416417
760	NC_004842	GCA	2	6	51836	51841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416417
761	NC_004842	CTG	2	6	51858	51863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416417
762	NC_004842	AGT	3	9	51945	51953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416417
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768	NC_004842	TGT	2	6	52392	52397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416417
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778	NC_004842	TCTG	2	8	52675	52682	0 %	50 %	25 %	25 %	56416417
779	NC_004842	ATC	2	6	52690	52695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416417
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782	NC_004842	ATC	2	6	52789	52794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416417
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